2σ Guide

M&Aで会社を売却した場合の
手取り額と税金

オーナー社長の株式譲渡事業譲渡、退職金、相続前後の売却、取得費加算、契約リスクを一体で整理し、実際に残る金額を考えるための実務ガイドです。

20.315%株式譲渡益の基本税率
約3.77億円5億円株式譲渡例の手取り
10か月相続税申告・納税期限
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M&Aで会社を売却した場合の 手取り額と税金

譲渡価額だけでなく、売却方式、税金、相続の順序、契約上の留保を合わせて確認します。

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M&Aで会社を売却した場合の 手取り額と税金
譲渡価額だけでなく、売却方式、税金、相続の順序、契約上の留保を合わせて確認します。
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2σ GUIDE ・ VIDEO

  • M&Aで会社を売却した場合の 手取り額と税金
  • 譲渡価額だけでなく、売却方式、税金、相続の順序、契約上の留保を合わせて確認します。

POINT 1

  • M&Aで会社売却したときの手取り額と税金の全体像
  • 譲渡価額だけでなく、売却方式、税金、相続の順序、契約上の留保を合わせて確認します。
  • 個人の株式譲渡は20.315%が基本
  • 事業譲渡は会社と個人の二段階
  • 相続前後で税負担と分割のしやすさが変わる

POINT 2

  • M&Aで会社を売却する方式と手取り額の違い
  • 1. 売る対象を確認:株式、事業、会社分割後の株式、自己株式取得のどれかを分けます。
  • 2. 代金の受取人を確認:オーナー個人が受け取るのか、会社が受け取るのかで税金の入口が変わります。
  • 3. 株式譲渡所得を中心に試算:取得費、譲渡費用、20.315%課税、相続後なら取得費加算を確認します。
  • 4. 法人段階と個人段階を分ける:法人税等、消費税等、退職金や配当などの資金移動を重ねて試算します。

POINT 3

  • M&Aの手取り額を計算する前に知る用語
  • 譲渡価額、取得費、譲渡費用、申告分離課税、留保代金を分けて理解します。
  • 手取り額の基本的な見方
  • 譲渡価額
  • 譲渡費用

POINT 4

  • 株式譲渡で会社売却する場合の税金と手取り額
  • 20.315%課税、取得費、譲渡費用、5億円案件の概算を確認します。
  • 株式譲渡の基本式
  • 創業者が株式を5億円で売る計算例
  • 取得費資料と譲渡費用の確認

POINT 5

  • 事業譲渡で会社売却する場合の税金と手取り額
  • 1. 会社が事業や資産を売却:譲渡益、簿価、時価、資産ごとの消費税区分を確認します。
  • 2. 会社段階の税金を試算:法人税、地方法人税、法人住民税、法人事業税、特別法人事業税などを確認します。
  • 3. 個人へ資金を移す方法を選ぶ:役員退職金、配当、給与、清算分配、貸付金返済、自己株式取得で税目が変わります。

POINT 6

  • 役員退職金を組み込む会社売却の税務
  • 実質的退職
  • オーナー社長が実際に退任し、引継ぎ期間後に経営から離れるかを確認します。
  • 過大役員退職給与
  • 退職金規程、株主総会決議、議事録、同業同規模比較、功績倍率の合理性を確認します。

POINT 7

  • 会社売却を相続前に行う場合と相続後に行う場合
  • 1. オーナー社長が生前に株式を売る:株式譲渡所得課税を受けた後、手取り現金を保有します。
  • 2. 株式のままなら非上場株式評価を行う:取引相場のない株式は、株主区分、会社規模、類似業種比準方式、純資産価額方式、配当還元方式などで評価します。
  • 3. 相続人が株式を売る:所得税上は、原則として被相続人の取得費を引き継ぎます。
  • 4. 取得費加算の特例を検討する:相続税額のうち一定金額を取得費に加算できる場合があり、譲渡所得税等を下げる効果があります。

POINT 8

  • 相続紛争と非上場株式評価がM&Aの手取りに与える影響
  • 株式を誰が取得するか
  • 後継者、配偶者、会社に関与しない相続人の利害が対立すると、売却同意や議決権行使が不安定になります。
  • 遺産分割未了の株式
  • 買主が全株式取得を希望しても、一部の相続人が反対すれば交渉が止まる可能性があります。

まとめ

  • M&Aで会社を売却した場合の 手取り額と税金
  • M&Aで会社売却したときの手取り額と税金の全体像:譲渡価額だけでなく、売却方式、税金、相続の順序、契約上の留保を合わせて確認します。
  • M&Aで会社を売却する方式と手取り額の違い:「会社を売る」という言葉の中身を分けると、税金と相続上の影響が見えます。
  • M&Aの手取り額を計算する前に知る用語:譲渡価額、取得費、譲渡費用、申告分離課税、留保代金を分けて理解します。
  • 本動画は一般的な情報提供であり、法律上の助言ではありません。記載の数値・金額・期間は目安です。個別事情で結論は変わります。
Overview

M&Aで会社売却したときの手取り額と税金の全体像

譲渡価額だけでなく、売却方式、税金、相続の順序、契約上の留保を合わせて確認します。

このページは、日本国内の中小企業、非上場会社、同族会社を念頭に、M&Aで会社を売却した場合のオーナー社長の手取り額と税金を整理します。相続事業承継、紛争予防、税務申告、契約実務が同時に関わるため、買主から示された金額だけで判断しないことが重要です。

基準日は2026年5月17日です。税制、通達、制度運用は変わり得るため、実行前には最新の法令、国税庁資料、中小企業庁資料、専門家意見を確認する必要があります。

前提個別案件の税額、契約条件、相続紛争の見通しは、事実関係、契約書、株主構成、財務諸表、相続人関係、税制改正により大きく変わります。このページは一般的情報であり、特定案件の法律意見、税務代理、鑑定評価、投資助言ではありません。

最初に押さえるべき結論は、株式譲渡、事業譲渡、相続前後の売却で手取りの見方が変わる点です。次の3つの要点は、どの専門家に相談する場合でも最初に共有すべき確認軸を表しています。

Point 1

個人の株式譲渡は20.315%が基本

非上場会社株式の譲渡益は、譲渡価額から取得費と譲渡費用を差し引き、所得税15%、復興特別所得税0.315%、住民税5%を合計した20.315%で考えるのが基本です。

Point 2

事業譲渡は会社と個人の二段階

会社が事業や資産を売る場合、代金はまず会社に入ります。法人税等や消費税等を考えたうえで、配当、役員退職金、清算分配などで個人に移す段階の課税も確認します。

Point 3

相続前後で税負担と分割のしやすさが変わる

死亡前に売れば相続財産は主に現金になります。死亡後に相続人が売る場合は、非上場株式評価、取得費の引継ぎ、取得費加算の特例を検討します。

Section 01

M&Aで会社を売却する方式と手取り額の違い

「会社を売る」という言葉の中身を分けると、税金と相続上の影響が見えます。

同じ「会社売却」でも、売るもの、代金を受け取る者、課税される主体が違います。次の比較表は、方式ごとの手取りへの影響を整理したもので、どの列を見るかによって税金の入口が変わることを読み取るために重要です。

方式売るもの代金を受け取る者税務上の中心論点相続との関係
株式譲渡オーナー社長が保有する株式オーナー社長など売主株主株式譲渡所得、取得費、譲渡費用、20.315%課税、取得費加算売却前死亡なら非上場株式評価、売却後死亡なら現金等として相続財産化
事業譲渡会社が保有する事業、資産、契約など会社法人税等、消費税等、資産移転、会社から個人への資金移転株式価値の変動、会社内留保金、清算、配当、退職金が問題
会社分割後の株式譲渡事業を別会社に移し、その株式を売るなど設計により異なる組織再編税制、株式譲渡、法人課税評価、遺留分、租税回避否認リスクにも注意
自己株式取得会社が株主から自社株を買い取る売主株主みなし配当、譲渡所得、相続株式の発行会社譲渡特例相続後の納税資金確保策として検討される場合がある

中小企業庁の中小M&Aガイドラインでは、株式譲渡は譲り渡し側の株主が譲り受け側に株式を譲渡する手法、事業譲渡は譲り渡し側が自社の事業を譲渡する手法と整理されています。承継対象財産を選択できる反面、財産の特定、対抗要件、許認可などの作業が必要になる場合があります。

売却方式の違いは、手取りをどこから計算するかに直結します。次の判断の流れは、代金が個人に直接入るのか、会社に入ってから個人へ移すのかを見分けるためのものです。

売却方式ごとの確認順序

売る対象を確認

株式、事業、会社分割後の株式、自己株式取得のどれかを分けます。

代金の受取人を確認

オーナー個人が受け取るのか、会社が受け取るのかで税金の入口が変わります。

個人が受け取る
株式譲渡所得を中心に試算

取得費、譲渡費用、20.315%課税、相続後なら取得費加算を確認します。

会社が受け取る
法人段階と個人段階を分ける

法人税等、消費税等、退職金や配当などの資金移動を重ねて試算します。

相続対策としてM&Aを検討する場合、親が売るのか、相続人が売るのか、会社が売るのか、発行会社が買い取るのかを最初に確定する必要があります。この区別を誤ると、同じ譲渡価額でもオーナー社長の手取り額は大きく異なります。

Section 02

M&Aの手取り額を計算する前に知る用語

譲渡価額、取得費、譲渡費用、申告分離課税、留保代金を分けて理解します。

手取り額は、買主から提示された譲渡価額そのものではありません。次の計算式は、実際に残る金額を押し下げる項目をまとめたもので、見積書や契約書のどこに影響が出るかを読み取るために重要です。

手取り額の基本的な見方

手取り額 = 実際に受け取る譲渡代金 - M&A仲介・FA手数料 - 弁護士・税理士・会計士等の専門家費用 - 譲渡所得税等 - 価格調整、エスクロー、ホールドバック、補償、保証解除などの影響

譲渡価額

譲渡価額とは、株式や事業を売った対価です。株式譲渡契約では固定額の場合もありますが、クロージング時の現預金、借入金、運転資本、純資産、税務リスクなどに基づいて価格調整を行う場合もあります。基本合意書で示された金額が、デュー・ディリジェンス後に変更されることも珍しくありません。

取得費

取得費は、売却する株式を取得するためにかかった費用です。設立時の払込額、増資払込額、過去の株式買取対価、購入手数料などが典型です。相続、遺贈、贈与により取得した株式は、原則として被相続人または贈与者の取得費を引き継ぎます。相続税評価額が高額でも、所得税上の取得費が同額になるとは限りません。

譲渡費用

譲渡費用は、譲渡のために直接必要となる費用です。M&A仲介手数料、FA手数料、契約書作成のための弁護士費用、税務ストラクチャー検討費用などが問題になります。ただし、支払者、契約内容、業務範囲、請求書の記載、支払時期によって取扱いが変わります。

譲渡所得と申告分離課税

株式譲渡所得等は、譲渡価額から取得費と譲渡費用を差し引いて計算します。プラスであれば課税対象となり、非上場株式の譲渡所得等は、通常、他の給与所得や事業所得などと合算せずに分離して確定申告で納税します。

計算式株式譲渡所得等 = 譲渡価額 - 取得費 - 譲渡費用

損失が出ても、非上場株式である一般株式等の損失と上場株式等の利益を相殺することはできません。国税庁は、上場株式等に係る譲渡所得等と一般株式等に係る譲渡所得等の間で損益通算できないと説明しています。

エスクロー、ホールドバック、表明保証

エスクローは、売却代金の一部を第三者口座などに留保し、一定期間後に条件を満たせば売主に支払う仕組みです。ホールドバックは、買主が譲渡代金の一部を一定期間支払わず、表明保証違反や補償請求がないことを確認してから支払う設計です。表明保証違反があれば補償義務を負うことがあり、収入計上時期、補償金の取扱い、手取り額の時期差に影響します。

Section 03

株式譲渡で会社売却する場合の税金と手取り額

20.315%課税、取得費、譲渡費用、5億円案件の概算を確認します。

個人オーナー社長が非上場株式を売却する場合、基本式は比較的明確です。次の式は、譲渡価額から何を差し引いて税額と手取りを概算するかを示しており、買主提示額と実際の手元資金の差を読むために重要です。

株式譲渡の基本式

課税対象となる譲渡益 = 株式譲渡価額 - 株式取得費 - 譲渡費用。税額概算 = 課税対象となる譲渡益 × 20.315%。手取り概算 = 株式譲渡価額 - 譲渡費用 - 税額概算。

20.315%は、所得税15%、復興特別所得税0.315%、住民税5%を合わせたものです。次の割合比較は、合計税率の内訳を示しており、どの税目が負担の中心かを読み取るために役立ちます。

所得税
15%
住民税
5%
復興特別所得税
0.315%
横の長さは20.315%の合計に対する構成比の目安です。

創業者が株式を5億円で売る計算例

次の表は、株式譲渡価額5億円、取得費1,000万円、譲渡費用3,000万円の前提を整理したものです。入力値を分けることで、税額が譲渡益にかかり、譲渡価額全体に直接かかるわけではないことを読み取れます。

項目金額
株式譲渡価額500,000,000円
設立時払込額等の取得費10,000,000円
M&A仲介、弁護士、税理士等の譲渡費用30,000,000円
エスクロー、補償実行、価格調整ここでは考慮しない
概算譲渡益は500,000,000円 - 10,000,000円 - 30,000,000円 = 460,000,000円です。税額概算は460,000,000円 × 20.315% = 93,449,000円、手取り概算は500,000,000円 - 30,000,000円 - 93,449,000円 = 376,551,000円です。

この例では、買主から5億円の提示を受けても、専門家費用と税金を差し引いた手取り概算は約3億7,655万円です。個人保証の解除費用、会社への貸付金放棄、補償請求、分割払いがある場合、実質手取りはさらに変動します。

取得費資料と譲渡費用の確認

創業から長期間が経過した会社では、設立時の払込証拠、株式売買契約書、増資資料、株主名簿、相続税申告書、贈与契約書、過去の譲渡資料が散逸していることがあります。取得費が立証できないと、概算取得費の利用や事実認定が問題になり、税負担が増える可能性があります。

M&A仲介会社、FA、弁護士、税理士、公認会計士の費用は、誰が契約当事者か、誰の利益のための役務か、株式売却に直接必要かによって、個人の譲渡費用になるか、会社の費用になるか、会社が個人に経済的利益を供与したものになるかが分かれます。仲介契約またはFA契約の依頼者、報酬率、最低手数料、発生時期、請求書の宛名、業務内容、消費税、支払口座を確認します。

Section 04

事業譲渡で会社売却する場合の税金と手取り額

代金が会社に入るため、法人段階と個人段階を分けて試算します。

事業譲渡では、売主は会社であり、買主からの代金は会社に入ります。次の二段階の確認は、オーナー社長個人の手取りを見誤らないために重要で、会社内に残る資金と個人の資金を区別して読む必要があります。

事業譲渡で手取りを確認する順序

会社が事業や資産を売却

譲渡益、簿価、時価、資産ごとの消費税区分を確認します。

会社段階の税金を試算

法人税、地方法人税、法人住民税、法人事業税、特別法人事業税などを確認します。

個人へ資金を移す方法を選ぶ

役員退職金、配当、給与、清算分配、貸付金返済、自己株式取得で税目が変わります。

普通法人の法人税率は、資本金1億円以下の法人などの年800万円以下部分には15%などの軽減税率があり、それ以外の普通法人は23.2%とされています。ただし、地方税を含む実効負担、適用除外事業者、グループ通算、所得金額年10億円超の場合などは別途検討を要します。

事業譲渡と消費税

株式の譲渡は有価証券の譲渡であり、消費税法上は原則として非課税取引です。一方、事業譲渡では、棚卸資産、機械装置、建物、のれん、土地、借地権、売掛金、契約上の地位、知的財産、営業権など、譲渡対象の資産ごとに消費税の課税、非課税、不課税を判定します。消費税を契約価格に含めるのか、別途外税で請求するのかも手取りに影響します。

会社からオーナーへの資金移転

事業譲渡後の会社に残る現預金は会社の資産であり、オーナー社長個人の現金ではありません。次の比較表は、会社から個人へ資金を移す方法ごとの税務論点を示し、どの方法が手取りにどう影響し得るかを読み取るために重要です。

資金移転方法税務上の主な論点実務上の注意
役員退職金退職所得、退職所得控除、2分の1課税、短期退職手当等、過大役員退職給与実質的退職、株主総会決議、功績倍率、買主との価格調整
配当配当所得、源泉徴収、総合課税、配当控除、住民税高所得者では税負担が重くなる可能性
給与・賞与給与所得、源泉徴収、社会保険、法人側損金性売却後の勤務実態が必要
貸付金返済元本返済なら原則として所得ではないが、利息は課税会社への貸付金の存在、契約書、会計処理が必要
清算分配みなし配当、譲渡所得、残余財産分配会社清算手続、債権者保護、公告、登記が必要
自己株式取得みなし配当と譲渡所得、相続株式特例発行会社による買取りは税務が複雑

個人オーナーの手取りを最大化するという観点では、株式譲渡と事業譲渡は全く別の構造です。事業譲渡を選ぶ場合は、法人段階の税金と個人段階の税金を合算した実効手取りを試算します。

Section 05

役員退職金を組み込む会社売却の税務

退職所得控除と2分の1課税だけでなく、過大性と価格調整を確認します。

M&Aでは、オーナー社長が会社売却と同時に退任し、役員退職金を受け取る設計が検討されることがあります。退職所得は長年の勤務に対する一時金という性質から一定の優遇がありますが、買主との価格調整や会社法手続も合わせて読む必要があります。

退職所得原則として、退職所得の金額は、退職手当等の収入金額から退職所得控除額を差し引いた残額の2分の1です。役員等としての勤続年数が5年以下である特定役員退職手当等については、2分の1計算が適用されません。

次の表は、30年勤続のオーナー社長に1億円の退職金を支払う前提を整理したものです。勤続年数が20年を超えると控除額の計算式が変わるため、年数と金額を分けて確認することが重要です。

項目金額
役員退職金100,000,000円
役員勤続年数30年
退職所得控除額8,000,000円 + 700,000円 × (30年 - 20年) = 15,000,000円
課税退職所得金額(100,000,000円 - 15,000,000円) × 1/2 = 42,500,000円

この42,500,000円に対して、所得税の累進税率、復興特別所得税、住民税を計算します。所得税率は5%から45%の7段階に区分されます。

役員退職金を検討するときの注意点は複数あります。次の一覧は、税務上の優遇だけで金額を決めると見落としやすい確認要素を示しており、退職金が本当に手取り改善に結びつくかを読むために重要です。

実質的退職

オーナー社長が実際に退任し、引継ぎ期間後に経営から離れるかを確認します。

過大役員退職給与

退職金規程、株主総会決議、議事録、同業同規模比較、功績倍率の合理性を確認します。

買主との価格調整

会社の現預金が退職金で減る場合、買主が株式譲渡価額を減額する可能性があります。

専門職の整合確認

法務、税務、会計、M&A契約の条件を同時に確認する必要があります。

退職金が機能しやすいのは、長期勤続で退職所得控除額が大きい場合、会社側の課税所得が減る一方で買主との価格調整で不利にならない場合、支給手続と資料が整っている場合です。

Section 06

会社売却を相続前に行う場合と相続後に行う場合

現金化、非上場株式評価、取得費加算、相続税率を一体で比較します。

相続前に売るか、相続後に相続人が売るかで、相続財産の形と所得税の計算が変わります。次の時系列は、売却時期ごとの課税の入口を示しており、相続税と譲渡所得税を単純比較しないために重要です。

相続前売却

オーナー社長が生前に株式を売る

株式譲渡所得課税を受けた後、手取り現金を保有します。死亡後は現金、預金、有価証券、不動産、貸付金などとして相続財産になります。

相続発生

株式のままなら非上場株式評価を行う

取引相場のない株式は、株主区分、会社規模、類似業種比準方式、純資産価額方式、配当還元方式などで評価します。

相続後売却

相続人が株式を売る

所得税上は、原則として被相続人の取得費を引き継ぎます。相続税評価額をそのまま取得費にできるわけではありません。

一定期間内

取得費加算の特例を検討する

相続税額のうち一定金額を取得費に加算できる場合があり、譲渡所得税等を下げる効果があります。

相続税の基礎控除と申告期限

相続税は、亡くなった人から相続などによって取得した財産の価額の合計額から債務などを差し引き、一定の加算をした正味遺産額が基礎控除額を超える場合に課税対象となります。基礎控除額は3,000万円 + 600万円 × 法定相続人の数です。申告と納税は、原則として死亡を知った日の翌日から10か月以内に行います。

取得費加算がある場合の5億円売却例

次の表は、相続後に株式を5億円で売り、取得費加算がある場合の前提です。相続税額の一部を取得費に加えることで、譲渡益がどれだけ下がるかを読み取るために重要です。

項目金額
株式譲渡価額500,000,000円
被相続人から引き継ぐ取得費10,000,000円
譲渡費用30,000,000円
取得費に加算できる相続税額60,000,000円
概算取得費加算がない場合、譲渡益は460,000,000円、税額概算は93,449,000円です。取得費加算が使える場合、譲渡益は400,000,000円、税額概算は81,260,000円、手取り概算は388,740,000円です。この例では税額が12,189,000円下がります。

実際の取得費加算額は、相続税額、取得財産の価額、譲渡資産、譲渡益上限、必要書類によって計算されます。相続税申告書の写し、取得費に加算される相続税の計算明細書、譲渡所得の明細書などの確認が必要です。

相続税率は、法定相続分に応ずる取得金額に応じて10%から55%までの累進税率です。譲渡所得税20.315%だけを見て「相続税より低い」と判断するのではなく、遺産全体、相続人の数、配偶者の税額軽減、小規模宅地等の特例、生命保険非課税枠、債務控除、過去贈与、遺留分、納税資金、二次相続まで含めて設計します。

Section 07

相続紛争と非上場株式評価がM&Aの手取りに与える影響

株式は支配権でもあるため、家族関係と評価方法が譲渡価額を左右します。

非上場会社の株式は、単なる金銭価値を持つ財産ではなく、議決権、役員選任権、配当期待、会社支配、事業継続、従業員雇用、取引先信用に直結します。次の注意点一覧は、相続人間の争いがM&A価格やクロージングにどう影響するかを示しており、手取りを守るために重要です。

株式を誰が取得するか

後継者、配偶者、会社に関与しない相続人の利害が対立すると、売却同意や議決権行使が不安定になります。

遺産分割未了の株式

買主が全株式取得を希望しても、一部の相続人が反対すれば交渉が止まる可能性があります。

評価額の食い違い

相続税評価、M&A価格、遺留分評価、会計士の株価算定、裁判所鑑定が一致しないことがあります。

納税期限と資金繰り

相続税納税期限までに売却できない場合、納税資金が不足し、交渉上の立場が弱くなることがあります。

オーナー社長が生前にM&Aを検討している場合、売却するか否かにかかわらず、遺言の整備は重要です。株式を後継者に集中させるのか、売却後現金をどう分けるのか、配偶者の生活資金をどう確保するのか、遺留分侵害額請求に備えるのかを明確にします。

非上場株式の相続税評価とM&A価格の違いは、紛争予防上の中心論点です。次の比較表は、それぞれの価格が何を基準に決まるかを示し、同じ会社でも金額が一致しない理由を読み取るために重要です。

評価の場面主な考慮要素ずれが生じる理由
相続税申告財産評価基本通達、株主区分、会社規模、類似業種比準方式、純資産価額方式、配当還元方式税務上の評価ルールに基づくため、買主固有の価値を反映しきれない場合があります。
M&A価格将来利益、業界再編、許認可、人材、技術、顧客基盤、買主の資金調達能力、競争入札買主のシナジーや交渉条件で、税務評価より高くも低くもなります。
紛争上の評価遺留分、代償金、裁判所鑑定、公認会計士算定、不動産鑑定相続人の主張、時点、資料、評価目的により金額が割れることがあります。

国税庁は2026年4月、取引相場のない株式の相続税評価について有識者会議を開催すると公表しました。評価方式間の評価額のかい離、規模の大きな会社ほど株式評価額が相対的に低く算定されること、配当還元方式の還元率などが検討趣旨として挙げられています。現時点で制度変更の具体的内容を断定すべきではありませんが、非上場株式を相続財産として抱えるオーナー家では、評価制度の将来変化もリスクとして認識します。

Section 08

自己株式取得・低額譲渡・親族間取引の税務リスク

納税資金対策や親族内承継は、みなし配当や贈与税の確認が必要です。

相続後の納税資金確保策として、相続人が相続した非上場株式を発行会社に売却し、会社から代金を受け取る方法が検討されることがあります。この場合、第三者への株式譲渡とは異なる税務が生じます。

自己株式取得会社が自己株式を取得し、株主に交付する金銭等が、その株式に対応する資本金等の額を超える場合、その超える部分は配当とみなされることがあります。配当所得は株式譲渡所得と税負担が異なるため、手取り額に大きな影響があります。

相続または遺贈により取得した非上場株式を発行会社へ譲渡する場合、一定要件の下で、通常ならみなし配当として扱われる部分についても株式等に係る譲渡所得等として課税される特例があります。要件には、相続または遺贈による取得、その相続または遺贈につき相続税額があること、相続開始日の翌日から相続税申告期限の翌日以後3年を経過する日までの発行会社への譲渡、発行会社への一定の通知などがあります。

自己株式取得や低額譲渡を検討するときは、税目だけでなく会社法と相続人間公平も合わせて確認します。次の一覧は、納税資金対策や親族内承継で手取りを損なう可能性のある論点を示しており、どの専門職に確認すべきかを読み取るために重要です。

会社法上の財源規制

自己株式取得では分配可能額、株主への通知、手続、資金繰り、金融機関対応を確認します。

みなし配当

配当所得になる部分があると、株式譲渡所得とは異なる課税になり、手取りが変わります。

低額譲渡

時価より著しく低い価額で個人間譲渡を行うと、時価と支払対価との差額が贈与とみなされる可能性があります。

時価の説明資料

第三者M&A価格を親族間譲渡や相続税評価にそのまま転用できるとは限らず、株価算定や税務評価の確認が必要です。

第三者買主との競争的な交渉により成立したM&A価格は、時価の一つの証拠になり得ます。ただし、買主固有のシナジー、経営者保証解除、雇用維持、競業避止、表明保証、分割払い、エスクロー、特殊な取引条件が含まれる場合、その価格を別の場面にそのまま使えるとは限りません。

Section 09

M&A契約と法務確認で手取り額を守る

価格調整、補償、保証解除、譲渡制限株式、名義株を事前に点検します。

株式譲渡契約では、クロージング日の現預金、借入金、純運転資本、純資産額に応じて譲渡価額を調整することがあります。税務上は、最終的な譲渡価額、収入計上時期、修正申告や更正の可能性が問題になります。

契約条項は、譲渡価額の見かけだけでなく、いつ、いくら、どの条件で受け取れるかを左右します。次の比較表は、代表的な契約条項が手取りに及ぼす影響を示しており、契約書レビューで重点的に読む箇所を見分けるために重要です。

契約・取引条件手取りへの影響確認事項
価格調整クロージング後に譲渡価額が増減する可能性現預金、借入金、運転資本、純資産、税務リスクの定義
アーンアウト初回受取額は低くなり、将来業績に応じて追加対価が発生収入時期、所得区分、条件の確定性、買主との紛争可能性
表明保証保険補償リスクを一定程度移転できるが、保険料や免責が発生除外事項、税務調査リスク、既知の問題の扱い
競業避止義務別建て対価にすると所得区分が問題になる可能性株式譲渡価額に含めるのか、役務対価にするのか
経営者保証解除未了なら高い売却価額でも実質的安心が得にくい解除または引継ぎをクロージング条件にするか

法務上の前提確認

中小企業の株式には、定款で譲渡制限が付いていることが多く、会社の承認機関、株主総会、取締役会、代表取締役、定款規定、株主間契約を確認します。承認手続を誤ると、買主が株主として扱われない、クロージング条件を満たせない、表明保証違反になるといった問題が起きます。

法務確認の対象は、定款だけではありません。次の一覧は、古い中小企業で見落とされやすい権利関係を示しており、買主の調査後に価格減額や補償請求につながるリスクを読み取るために重要です。

株券発行会社のままの定款

株券を実際に発行しているか、紛失していないか、株券不所持申出や株券廃止手続が必要かを確認します。

名義株

親族、従業員、知人名義の株式について、実質所有を相続人や名義人が争う可能性があります。

少数株主

全株式取得を望む買主に対し、少数株主との交渉、株式併合、スクイーズアウト、価格決定申立てリスクを検討します。

会社利用資産

個人所有資産と会社利用の混同、不動産、許認可、知的財産名義、労務リスクを整理します。

Section 10

会社売却・相続・税金で連携する専門職

法律、税務、会計、登記、評価、資産管理を横断して役割を分けます。

M&Aを相続対策として使う場合、税理士だけ、弁護士だけ、M&A仲介会社だけでは論点が分断されやすくなります。次の表は、専門職ごとの主な役割を整理したもので、誰に何を確認するかを読み取るために重要です。

専門職主な役割
弁護士株式譲渡契約、事業譲渡契約、基本合意書、秘密保持契約、表明保証、補償、価格調整、競業避止、経営者保証、相続紛争、遺留分、遺産分割、調停、審判、訴訟
税理士株式譲渡所得、取得費、譲渡費用、取得費加算、相続税申告、贈与税、役員退職金、法人税、消費税、自己株式取得、みなし配当、税務調査対応
公認会計士企業価値評価、財務デュー・ディリジェンス、正常運転資本、純有利子負債、EBITDA、簿外債務、偶発債務、財務諸表の信頼性確認
司法書士商業登記、不動産登記、相続登記、株式譲渡後の役員変更登記、会社分割や組織再編の登記、相続登記義務化への対応
行政書士紛争性のない遺産分割協議書、相続人関係説明図、許認可承継に関する書類作成、許認可業種のM&A手続支援
公証人、遺言執行者公正証書遺言の作成、遺言内容の実現、相続開始後の株式、預金、不動産、M&A関連債権の処理
不動産鑑定士、土地家屋調査士、宅地建物取引士不動産評価、境界、分筆、売却、賃貸借、借地権、土壌汚染、建物瑕疵の確認
弁理士特許、商標、意匠、著作権、ノウハウ、ライセンス契約の確認
中小企業診断士、FP事業承継計画、後継者育成、経営改善、売却後の生活資金、納税資金、保険、老後資金、二次相続の全体設計

事業承継税制とM&A

法人版事業承継税制は、非上場会社の株式に係る贈与税、相続税の納税猶予および免除を受け得る制度です。特例措置では、特例承継計画の提出期限が令和9年9月30日まで、平成30年1月1日から令和9年12月31日までに贈与または相続により会社株式を取得した経営者が対象とされています。対象株式数の上限撤廃や猶予割合100%への拡大も説明されています。

ただし、これは家族内または親族外の後継者が会社を継続することを前提に、相続税や贈与税の納税を猶予する制度です。会社を売却して自由に現金化するための制度ではありません。対象株式の継続保有、代表者要件、報告、届出が求められ、制度適用中のM&Aには慎重な検討が必要です。

親族内に後継者がいない、後継者候補が経営リスクを負いたくない、相続税納税資金を確保したい、従業員雇用や取引先を守りたい、兄弟姉妹間の支配権争いを避けたい、オーナー社長の老後資金を確保したい、業界再編により今売る方が企業価値が高い場合には、事業承継税制よりM&Aを優先して検討することがあります。

Section 11

M&Aで会社売却する前の手取り試算モデル

株式譲渡と事業譲渡を同じ土俵で比較し、契約リスクまで反映します。

株式譲渡の詳細試算

株式譲渡では、譲渡価額だけでなく、入金時期、取得費、譲渡費用、税金、契約リスク、相続税、生活資金を同じ表で確認します。次の表は、手取り試算に入れる項目を漏らさないためのものです。

区分確認項目説明
譲渡価額基本価格、価格調整、アーンアウト実際に確定する価格を確認
入金時期クロージング時、分割、エスクロー税金支払い時期とずれる可能性
取得費設立払込、増資、過去取得、相続取得証拠資料の有無が重要
譲渡費用仲介、FA、弁護士、税理士、会計士支払者と業務内容を確認
税金所得税、復興特別所得税、住民税20.315%が基本
契約リスク補償、表明保証、価格調整将来の返金リスク
相続税売却前後の相続財産現金化により分割は容易化
生活資金老後資金、贈与、保険売却後の資産管理が必要

事業譲渡の詳細試算

事業譲渡では、会社段階と個人段階を分ける必要があります。次の表は、どの段階でどの税金や手続が生じるかを整理したもので、二重に課税関係が生じる可能性を読み取るために重要です。

段階確認項目説明
会社段階譲渡対象資産、簿価、時価、譲渡益法人税等の基礎
会社段階消費税の課税、非課税、不課税土地、株式、のれん、設備で異なる
会社段階許認可、契約移転、従業員承継譲渡価額に影響
個人段階役員退職金退職所得課税と会社損金性
個人段階配当配当所得課税
個人段階清算分配みなし配当、譲渡所得
個人段階相続税会社株式価値や現金化後資産

5億円案件の比較イメージ

同じ5億円の支払額でも、株式譲渡と事業譲渡では代金を受け取る主体と追加課税の有無が異なります。次の比較表は、手取りの把握が単純か二段階になるかを読み取るために重要です。

項目株式譲渡事業譲渡
買主から見た支払額5億円5億円
代金を受け取る者オーナー株主会社
最初に課税される主体オーナー個人会社
主な税金株式譲渡所得課税20.315%法人税等、消費税等
個人に移す追加課税原則不要配当、退職金、清算等で追加課税
手取りの把握比較的単純二段階計算が必要
相続対策上の特徴現金化により分割しやすい会社内資金と株式価値の設計が必要
Section 12

会社売却の手取り額と税金でよくある誤解

断定ではなく、一般的な制度説明として確認します。

会社を5億円で売れば5億円が手元に残りますか

一般的には、株式譲渡では譲渡費用と譲渡所得税等が差し引かれ、事業譲渡では代金が会社に入り、会社課税と個人への資金移転課税を考える必要があります。ただし、契約条件、取得費、費用負担、補償条項、入金時期によって結論は変わる可能性があります。具体的な試算は、契約書案や税務資料を整理したうえで税理士、弁護士等の専門家へ相談する必要があります。

非上場株式の相続税評価額がそのまま取得費になりますか

一般的には、相続、遺贈、贈与で取得した株式の所得税上の取得費は、被相続人または贈与者の取得費を引き継ぐとされています。ただし、取得費加算の特例、取得資料の有無、相続税申告内容、譲渡時期によって税額は変わる可能性があります。具体的な対応は、資料を整理したうえで税理士等の専門家へ相談する必要があります。

親族に安く売れば節税になりますか

一般的には、時価より著しく低い価額で個人から個人へ財産を移すと、時価との差額が贈与とみなされる可能性があります。ただし、時価の判断、取引条件、相手方、会社の状況、評価資料によって結論は変わる可能性があります。具体的な譲渡価額や税務上の見通しは、税理士、弁護士、公認会計士等へ相談する必要があります。

役員退職金を高くすれば税負担は下がりますか

一般的には、退職所得には退職所得控除や2分の1課税などの取扱いがありますが、過大な役員退職給与は会社側で損金不算入となる可能性があり、買主が株式譲渡価額を調整する可能性もあります。ただし、勤続年数、実質的退職、支給規程、決議、会社の利益状況、M&A契約条件で結論は変わります。具体的な金額設計は、専門家へ相談する必要があります。

M&A仲介会社に任せれば税金や相続も自動的に整理されますか

一般的には、仲介会社やFAはM&Aプロセスを支援しますが、税務代理、法律紛争代理、登記、鑑定などは各専門職の領域です。ただし、依頼先の業務範囲、契約内容、関与する専門職の体制によって支援内容は異なります。具体的な税務、法務、相続の判断は、必要な資料を整理して各専門家へ相談する必要があります。

Section 13

相続に悩むオーナー家の実行チェックリスト

初期診断、税務試算、契約前確認、相続紛争予防を順番に進めます。

初期診断

初期診断では、会社の支配関係と相続関係を同時に確認します。次の一覧は、M&A価格や相続税の試算に入る前に集めるべき資料を示しており、後から取得費や株主権を争わないために重要です。

確認項目内容
会社の基本資料株主名簿、定款、登記簿、株券発行有無
取得費資料設立払込、増資、過去の売買、贈与、相続に関する証拠
相続関係相続人、推定相続人、遺留分権利者、遺言の有無と内容
金融・担保会社借入、経営者保証、担保、不動産
会計・税務税務申告書、決算書、総勘定元帳、固定資産台帳
会社との貸借会社への貸付金、役員借入金、未払役員報酬
事業リスク許認可、知的財産、主要契約、労務リスク

M&A前の税務試算

税務試算では、株式譲渡、事業譲渡、会社分割後譲渡を横並びにします。取得費、譲渡費用、税額、住民税納付時期、役員退職金、相続前後の売却、取得費加算、自己株式取得、相続税納税期限までの資金繰りを確認します。

契約前の法務確認

契約前には、基本合意書の拘束力、秘密保持義務、情報開示範囲、デュー・ディリジェンス資料、表明保証の範囲、補償上限、補償期間、免責金額、価格調整、エスクロー、ホールドバック、経営者保証解除、競業避止義務、引継ぎ期間、顧問契約を確認します。

相続紛争予防

相続紛争予防では、公正証書遺言、遺言執行者、生命保険による納税資金や代償金原資、遺留分侵害額請求への備え、家族会議の記録、会社に関与しない相続人への説明資料、会社価値評価の複数の見方、M&A成立前に死亡した場合の対応を整理します。

Section 14

M&Aで会社売却を進める実務プロセス

30日、90日、買主探索前に分けて、手取りを守る準備を進めます。

会社売却は、売るかどうかを決める前の資料整理で手取りが変わります。次の時系列は、初動から買主探索前までの行動順を示しており、税額、紛争、価格減額リスクを同時に抑えるために重要です。

30日以内

事実を集める

株主名簿、定款、登記簿、決算書、税務申告書、取得費資料、借入金明細、保証契約、遺言、相続人関係図を集めます。税理士に株式譲渡の概算税額を依頼し、弁護士に相続人関係と契約リスクを確認してもらいます。

90日以内

売却方式を比較する

株式譲渡、事業譲渡、退職金併用、相続前売却、相続後売却、自己株式取得、親族内承継、事業承継税制を一覧にし、税額、手取り、紛争リスク、従業員影響を比較します。

買主探索前

見えないリスクを整理する

未払残業代、社会保険、税務調査リスク、役員貸付金、在庫評価、不動産問題、許認可、契約上のチェンジ・オブ・コントロール条項、知的財産名義、個人所有資産と会社利用の混同を確認します。

買主探索前に社内リスクを整理できれば、デュー・ディリジェンス後の価格減額を避け、手取り額を守りやすくなります。特に経営者保証、名義株、少数株主、相続人間の同意状況は、買主の不安に直結します。

Section 15

M&Aで会社売却した手取り額は構造で決まる

税率表だけでなく、契約、相続、評価、専門職連携まで含めて設計します。

M&Aで会社を売却した場合のオーナー社長の手取り額と税金を考えるうえで、最も重要なのは譲渡価額ではなく構造です。次のまとめは、方式ごとに最後に確認すべき論点を示しており、個別試算に入る前の全体確認として重要です。

手取り額を守る最終確認

個人株主が株式を売るなら20.315%課税、取得費、譲渡費用を確認します。相続で取得した株式なら取得費の引継ぎと取得費加算を確認します。会社が事業を売るなら、会社段階と個人段階を二段階で試算します。

役員退職金を組み込むなら、退職所得の優遇だけでなく、過大性、会社法手続、買主との価格調整を見ます。相続が絡むなら、遺言、遺留分、遺産分割、相続税納税資金、非上場株式評価、相続人間の支配権争いを同時に処理します。

最終的な手取り額は、税率表だけで決まりません。契約条項、仲介手数料、取得費資料、相続の順序、会社の内部リスク、家族関係、専門職の連携により決まります。法律、税務、会計、登記、相続、評価、資産管理を横断するチームで設計することが、オーナー社長と相続人の手取りを守るために重要です。

Reference

会社売却M&Aと相続税の参考資料

税務・相続税の一次情報

  • 国税庁「No.1463 株式等を譲渡したときの課税(申告分離課税)」
  • 国税庁「No.1464 譲渡した株式等の取得費」
  • 国税庁「No.3267 相続財産を譲渡した場合の取得費の特例」
  • 国税庁「No.1477 相続により取得した非上場株式をその発行会社に譲渡した場合の課税の特例」
  • 国税庁「No.1420 退職金を受け取ったとき(退職所得)」
  • 国税庁「No.2260 所得税の税率」
  • 国税庁「No.4102 相続税がかかる場合」
  • 国税庁「No.4155 相続税の税率」
  • 国税庁「No.4638 取引相場のない株式の評価」
  • 国税庁「No.4423 著しく低い価額で財産を譲り受けたとき」
  • 国税庁「No.6201 非課税となる取引」
  • 国税庁「No.6931 消費税等と譲渡所得」
  • 国税庁「No.5759 法人税の税率」

中小企業M&A・事業承継の資料

  • 中小企業庁「中小M&Aガイドライン 第3版」
  • 中小企業庁「中小M&Aガイドライン 第3版」手数料、FA、仲介契約に関する記載
  • 中小企業庁「中小M&Aガイドライン 第3版」最終契約、経営者保証、表明保証、補償、クロージングに関する記載
  • 中小企業庁「法人版事業承継税制 特例措置」
  • 国税庁「取引相場のない株式の評価に関する有識者会議の開催について」