2σ Guide

M&Aと相続税の関係
売却前に亡くなった場合の株式評価

基本合意後、株式譲渡契約後、クロージング前後に会社オーナーが亡くなった場合の非上場株式評価、総則6項、譲渡所得、会社法手続を横断的に整理します。

8,186円東京高裁事案の通達評価額
105,068円基本合意・実際の譲渡価額
10か月相続税申告期限の目安
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M&Aと相続税の関係 売却前に亡くなった場合の株式評価

まず、相続 開始時点の財産、通達評価、総則6項、譲渡所得を分けて整理します

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M&Aと相続税の関係 売却前に亡くなった場合の株式評価
まず、相続 開始時点の財産、通達評価、総則6項、譲渡所得を分けて整理します
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2σ GUIDE ・ VIDEO

  • M&Aと相続税の関係 売却前に亡くなった場合の株式評価
  • まず、相続 開始時点の財産、通達評価、総則6項、譲渡所得を分けて整理します

POINT 1

  • M&Aと相続税の全体像 ― 売却前死亡時の株式評価をつかむ
  • まず、相続 開始時点の財産、通達評価、総則6項、譲渡所得を分けて整理します
  • M&A価格と相続税評価額は同じとは限りません
  • 取得した財産を確定する
  • 通達評価を正確に行う

POINT 2

  • M&Aと相続税で最初に確定する権利関係
  • 1. 相続開始時点を固定する:死亡日に、株式、契約、代金、承認手続がどこまで進んでいたかを確認します。
  • 2. 株式譲渡契約の有無と拘束力を確認:基本合意か最終契約か、価格や譲渡義務が法的拘束力を持つかを分けます。
  • 3. 代金債権に近い評価を検討:主要条件が満たされ、売主側に残代金請求権が実質的に発生しているかを検討します。
  • 4. 株式としての通達評価を検討:買収監査、譲渡承認、価格調整、株式集約などが残る場合は株式評価が出発点になります。

POINT 3

  • M&A売却前死亡の時系列別に見る相続税評価
  • 1. 通常は株式評価から検討:売却代金債権は通常発生していません。
  • 2. 最も争点になりやすい段階:譲渡予定価格、独占交渉、買収監査、従業員処遇などが記載されても、価格や譲渡義務が法的拘束力を持たないことがあります。
  • 3. 条件未充足の実質を確認:重要な許認可、表明保証、主要取引先同意、金融機関同意、譲渡承認、価格調整が残る場合があります。
  • 4. 未収入金や条件付き債権の評価へ:株式移転が実行済みなら、株式ではなく、未収入金、エスクロー返還請求権、アーンアウト請求権などが問題になります。
  • 5. 相続税と譲渡所得を分ける:相続税は相続開始時点の価額、譲渡所得は売却時の所得として考えます。

POINT 4

  • M&A前後の非上場株式評価と通達評価の進め方
  • 1. 株式の種類を確認:上場株式、気配相場等のある株式、取引相場のない株式のいずれかを確認します。
  • 2. 取得者の株主区分を判定:同族株主等か、同族株主以外の株主等かを判定します。
  • 3. 原則的評価方式:会社規模に応じて類似業種比準方式、純資産価額方式、併用方式を検討します。
  • 4. 配当還元方式を検討:会社支配力が乏しい株主について、配当を基礎にした特例的評価方式を検討します。

POINT 5

  • M&A価格と相続税評価額の乖離と総則6項リスク
  • 売却の高度な確実性
  • 相続開始前に売却価格、買主、対象株式数、主要条件が実質的に確定している場合です。
  • 契約の法的拘束力
  • 最終契約に近い文書が締結され、価格や譲渡義務に拘束力がある場合です。

POINT 6

  • M&Aと相続で問題になる会社法手続と株主名簿
  • 譲渡制限株式、共同相続、名義書換、売主の確定を整理します
  • 譲渡制限株式と会社法手続
  • 共同相続と売主の確定
  • 株主名簿と対抗要件

POINT 7

  • M&A後の譲渡所得と相続税申告期限を分けて考える
  • 1. 相続人とM&A状況の把握:戸籍、株主名簿、契約書、買主との交渉状況、譲渡承認の有無を集め、専門職の役割分担を決めます。
  • 2. 準確定申告の要否を確認:被相続人に譲渡所得が帰属する可能性がある場合、契約日、引渡日、代金決済、株主名簿書換を確認します。
  • 3. 相続税申告と納税:非上場株式評価、総則6項分析、遺産分割、取得費加算の見込み、納税資金を整合させます。
  • 4. 譲渡所得申告:相続人が売却した場合は、相続税評価額ではなく被相続人から引き継いだ取得費を前提に計算します。

POINT 8

  • M&A売却前後の死亡を具体例で比較する
  • 基本合意後、最終契約後、クロージング後、相続後売却の違いを見ます
  • 例1に近い場合の実務整理
  • 例2と例3に近い場合の実務整理
  • 具体例を見ると、同じM&A売却前後の死亡でも、評価対象と税務処理が大きく変わることが分かります。

まとめ

  • M&Aと相続税の関係 売却前に亡くなった場合の株式評価
  • M&Aと相続税の全体像 ― 売却前死亡時の株式評価をつかむ:まず、相続 開始時点の財産、通達評価、総則6項、譲渡所得を分けて整理します
  • M&Aと相続税で最初に確定する権利関係:株式、代金債権、条件付き権利のどれを相続したのかを切り分けます
  • M&A売却前死亡の時系列別に見る相続税評価:基本合意前後、最終契約前後、クロージング後で評価の出発点が変わります
  • 本動画は一般的な情報提供であり、法律上の助言ではありません。記載の数値・金額・期間は目安です。個別事情で結論は変わります。
Overview

M&Aと相続税の全体像 ― 売却前死亡時の株式評価をつかむ

まず、相続開始時点の財産、通達評価、総則6項、譲渡所得を分けて整理します

M&Aの売却前に会社オーナーが亡くなった場合、最初に見るべき点は、相続開始時点で相続人が取得した財産の中身です。被相続人がまだ株式を持っていたのか、株式譲渡契約上の代金債権を取得していたのか、停止条件付きの権利義務関係にとどまっていたのかで、相続税評価の出発点が変わります。

典型的な中小企業M&Aでは、秘密保持契約、FA契約、基本合意、買収監査、価格協議が進んでいても、最終契約やクロージングが未了であれば、相続税申告では取引相場のない株式として財産評価基本通達に基づき評価することが基本になります。相続後に高額で売却できた事実は重要な資料ですが、それだけで直ちに売却価額が相続税評価額になるとは限りません。

次の重要ポイントは、M&Aと相続税が重なったときに最初に押さえるべき結論を整理したものです。どの論点が実務上の分岐点になるかを把握できるため、相続税申告、譲渡所得、遺産分割、会社法手続を同時に検討するときの優先順位を読み取れます。

M&A価格と相続税評価額は同じとは限りません

基本合意価格や相続後の売却価格は重要な証拠になりますが、相続開始時点の権利関係、契約の拘束力、条件成就、租税負担軽減目的の有無、評価方法の合理性を総合して判断します。

次の一覧は、M&A売却前死亡の場面で特に重要な三つの判断軸を並べたものです。各項目は後の章で詳しく扱うため、まずは「財産の種類」「評価方法」「総則6項リスク」が別々の問題として動くことを読み取ってください。

Asset

取得した財産を確定する

相続開始時点で株式を取得したのか、売買代金債権を取得したのか、条件付きの契約上の地位を承継したのかを確認します。

Valuation

通達評価を正確に行う

非上場会社の株式では、同族株主等判定、会社規模、特定会社該当性、類似業種比準方式、純資産価額方式などを順に検討します。

Evidence

価格差の理由を説明する

M&A価格と通達評価額が大きく違う場合、価格形成要因、契約未確定性、事業上の目的、税負担軽減目的の有無を資料で整理します。

東京高裁令和6年8月28日判決の示した重要な線引き

基本合意後に相続が発生し、相続後に基本合意と同額で株式が売却された事案では、通達評価額が1株8,186円、基本合意および実際の譲渡価額が1株105,068円、課税庁の評価額が1株80,373円とされていました。それでも、価格差だけで財産評価基本通達6項を納税者に不利に適用することはできないと整理された点が重要です。

ただし、どのような場合でも通達評価で足りるという意味ではありません。最高裁令和4年4月19日判決は、評価通達による画一的評価が実質的な租税負担の公平に反する事情がある場合、通達評価額を上回る評価を用いる合理的理由があり得ると判示しています。M&Aと相続税の接点では、売却価格だけでなく、契約の拘束力、条件の充足状況、取引の経済合理性を証拠で確認する必要があります。

次の比較表は、この記事が想定する読者と典型的な悩みを整理しています。読者ごとに見たい論点が違うため、自分の立場に近い行から、税務、会社法、遺産分割のどこを重点的に読むべきかを確認できます。

読者典型的な悩み重点論点
会社オーナーの相続人亡くなる前から進んでいたM&A価格で相続税を払うのか、通達評価でよいのかが分からない相続開始時点の権利関係、総則6項、相続税申告
後継者、配偶者、子遺産分割と株式売却を同時に進める必要があり、誰が売主になるべきか悩む共同相続、売主の確定、譲渡所得の帰属
少数株主の相続人同族株主か少数株主かで評価方法が変わるのかを知りたい同族株主等判定、配当還元方式
M&A担当者亡くなった売主側の相続人と契約を進める際、どの資料を残すべきか知りたい基本合意、買収監査、譲渡承認、議事録
専門職、金融機関、仲介担当者近時の裁判例を踏まえて実務対応を整理したい最高裁判決、東京高裁判決、説明資料の作り方
Section 01

M&Aと相続税で最初に確定する権利関係

株式、代金債権、条件付き権利のどれを相続したのかを切り分けます

M&Aと相続税評価の用語

M&Aは、会社または事業の支配権、経営権、資産、事業部門を第三者に移転する取引です。中小企業の事業承継型M&Aでは、非上場会社の株式譲渡が最も典型的で、会社そのものは存続し、株主が変わります。

相続税評価は、相続または遺贈により取得した財産の価額を相続税計算のために評価することです。相続税法22条は、特別の定めがあるものを除き、取得の時における時価によると定めています。

次の一覧は、このページで繰り返し使う主要概念をまとめたものです。似た言葉でも評価目的や対象が違うため、表の左列で用語を確認し、右列で相続税評価との関係を読み取ってください。

Unlisted

取引相場のない株式

上場株式や気配相場等のある株式以外の株式です。中小企業、同族会社、譲渡制限株式の多くが該当します。

Method

通達評価額

財産評価基本通達に定める方法で算定した評価額です。課税実務で画一的な処理を可能にする基準として重要です。

Deal Price

M&A価格

買主が売主に支払う株式譲渡代金などの取引価格です。DCF法、EBITDA倍率、シナジー、支配権プレミアム、補償条項などの影響を受けます。

Clause 6

財産評価基本通達6項

通達の定めで評価することが著しく不適当と認められる財産について、国税庁長官の指示を受けて評価する旨の規定です。

相続開始時点で何を取得したのか

M&Aの売却前に死亡した場合、評価の出発点は「株式を相続したのか」「売買代金債権を相続したのか」「条件付きの権利関係を相続したのか」です。この判断を誤ると、通達評価、債権評価、譲渡所得、遺産分割の前提がすべてずれます。

次の判断の流れは、相続開始時点の権利関係を整理する順番を示しています。上から順に確認することで、株式評価で進む場面と、代金債権や条件付き権利の評価を検討する場面の違いを読み取れます。

相続開始時点の財産を見極める順番

相続開始時点を固定する

死亡日に、株式、契約、代金、承認手続がどこまで進んでいたかを確認します。

株式譲渡契約の有無と拘束力を確認

基本合意か最終契約か、価格や譲渡義務が法的拘束力を持つかを分けます。

条件充足に近い
代金債権に近い評価を検討

主要条件が満たされ、売主側に残代金請求権が実質的に発生しているかを検討します。

未確定要素が大きい
株式としての通達評価を検討

買収監査、譲渡承認、価格調整、株式集約などが残る場合は株式評価が出発点になります。

確認すべき八つの問い

相続人は、被相続人の財産に属した一切の権利義務を相続開始時から承継します。ただし、一身専属的な権利義務は除かれます。株式を保有していれば株式が、契約上の代金債権を取得していれば債権が、相続財産となります。

  1. 相続開始時点で、被相続人は株式をまだ所有していたか。
  2. 株式譲渡契約は締結済みか。
  3. その契約は法的拘束力を有するか。
  4. クロージング条件は満たされていたか。
  5. 代金は支払済みか、未収か。
  6. 株主名簿書換、株券交付、譲渡承認、競争法や業法上の承認など、所有権移転に必要な手続は完了していたか。
  7. 基本合意は価格を法的に拘束するものか、協議の枠組みにとどまるものか。
  8. 相続後の売却成立は、相続開始時点で既に確定していた結果か、相続人の交渉、代表者就任、株式集約、買収監査、金融機関対応などにより実現した結果か。
Section 02

M&A売却前死亡の時系列別に見る相続税評価

基本合意前後、最終契約前後、クロージング後で評価の出発点が変わります

M&Aの進行段階ごとの相続税評価

M&Aの売却前死亡では、同じ「売却前」でも、秘密保持契約だけの段階と最終契約後の段階では評価の出発点が大きく変わります。次の時系列は、各段階で相続財産の見方がどう動くかを示すため、死亡時点がどこに入るかを読み取ることが重要です。

秘密保持契約、FA契約、初期交渉

通常は株式評価から検討

売却代金債権は通常発生していません。買主候補の撤退、買収監査、価格変更、株主同意未了などの不確定要素が残ります。

基本合意後、最終契約前

最も争点になりやすい段階

譲渡予定価格、独占交渉、買収監査、従業員処遇などが記載されても、価格や譲渡義務が法的拘束力を持たないことがあります。

株式譲渡契約後、クロージング前

条件未充足の実質を確認

重要な許認可、表明保証、主要取引先同意、金融機関同意、譲渡承認、価格調整が残る場合があります。

クロージング完了後、代金未収

未収入金や条件付き債権の評価へ

株式移転が実行済みなら、株式ではなく、未収入金、エスクロー返還請求権、アーンアウト請求権などが問題になります。

相続後に相続人が売却

相続税と譲渡所得を分ける

相続税は相続開始時点の価額、譲渡所得は売却時の所得として考えます。取得費は原則として被相続人の取得費を引き継ぎます。

次の比較表は、各段階で相続税評価がどちらへ寄りやすいかを整理したものです。左列の進行状況と右列の評価方向を照らし合わせ、株式評価で足りるのか、代金債権や条件付き権利の評価が必要かを読み取ってください。

状況相続税評価の方向性
株式譲渡契約が有効に成立し、価格も確定し、主要条件も実質的に満たされ、相続開始時点で売主側に残代金請求権が実質的に発生している株式ではなく代金債権、または代金債権に近い権利として評価する余地が大きい
株式譲渡契約はあるが、多数の停止条件が未充足で、解除や価格調整の可能性が実質的に残る株式、条件付き権利、契約上の地位を個別に検討する
基本合意に近い文書で、価格や譲渡義務が拘束されない原則として株式として通達評価を検討する
契約上は拘束力があるが、譲渡制限株式の承認が未了で会社法上の手続が残る会社法上の制限と契約上の債権債務を分けて検討する
アーンアウト、エスクロー、価格調整、補償債務が残る未確定債権や偶発債務を含めた評価が必要になる

不動産売買の取扱いを機械的に当てはめない

不動産については、売買契約締結後、引渡しおよび代金決済が未了の段階で売主に相続が開始した場合、相続財産は残代金請求権であるとされる取扱いがあります。しかし株式M&Aでは、契約構造、譲渡制限、株券の有無、株主名簿書換、停止条件、解除条件、クロージング前誓約が複雑です。不動産の考え方を機械的に当てはめるのは危険です。

相続後に売却した場合の二つの税目

相続開始時点で被相続人が株式を保有し、相続人がその株式を相続後にM&Aで売却した場合、相続税と所得税の二つの問題が生じます。相続税では相続開始時点の株式価額を評価し、相続人が売却した時点では株式譲渡所得が生じる可能性があります。上場株式等と一般株式等の譲渡所得等は申告分離課税で扱われ、所得税15%、住民税5%を基本とし、復興特別所得税が上乗せされます。

Section 03

M&A前後の非上場株式評価と通達評価の進め方

同族株主等判定、会社規模、評価方式、特定会社該当性を順に確認します

取引相場のない株式評価の全体構造

非上場会社の株式評価は、いきなりM&A価格と比較するのではなく、財産評価基本通達の通常ルールを順に確認する必要があります。次の判断の流れは、どの評価方式に進むかを整理するもので、同族株主等判定と会社規模判定が評価額に大きく影響することを読み取れます。

非上場株式評価の確認順序

株式の種類を確認

上場株式、気配相場等のある株式、取引相場のない株式のいずれかを確認します。

取得者の株主区分を判定

同族株主等か、同族株主以外の株主等かを判定します。

同族株主等
原則的評価方式

会社規模に応じて類似業種比準方式、純資産価額方式、併用方式を検討します。

少数株主側
配当還元方式を検討

会社支配力が乏しい株主について、配当を基礎にした特例的評価方式を検討します。

次の比較表は、原則的評価方式で使う主な評価方法を会社規模ごとに整理したものです。会社規模が変わると評価方式も変わるため、M&A価格との差を見る前に、通常の評価区分が正しいかを確認してください。

会社規模原則的な評価方法確認すべき点
大会社類似業種比準方式上場会社に近い規模を前提に、配当、利益、純資産などの比準要素を確認します。
中会社類似業種比準方式と純資産価額方式の併用方式会社規模に応じた併用割合と、直前期の財務数値を確認します。
小会社純資産価額方式会社の資産と負債を相続税評価に洗い替え、純資産を基礎にします。
特定の評価会社原則として純資産価額方式等株式等保有特定会社、土地保有特定会社、開業後3年未満の会社などの該当性を確認します。

原則的評価方式と配当還元方式

同族株主等が取得した場合は原則的評価方式が基本です。類似業種比準方式は、評価会社と類似する上場会社の株価を基礎に、配当、利益、純資産などの比準要素を用います。純資産価額方式は、会社の資産と負債を相続税評価に洗い替え、純資産を基礎に株式価額を計算します。

配当還元方式は、会社支配力の乏しい少数株主が配当を期待するにとどまる実態に着目した特例的評価方式です。M&Aでは支配株式の売却が多いため、配当還元方式を使えるとは限りません。相続人が取得した株式が、被相続人の同族関係者を含めてどの議決権割合に属するか、会社に同族株主がいるか、中心的な同族株主に該当するかを慎重に判定します。

次の一覧は、M&A直前の非上場株式評価で見落としやすい論点をまとめたものです。通常ルールの確認漏れが総則6項以前の問題になり得るため、各項目から評価明細書や根拠資料に不足がないかを読み取ってください。

同族株主等判定

取得者単独ではなく、同族関係者を含めた議決権割合、中心的な同族株主該当性、少数株主側の位置づけを確認します。

会社規模判定

従業員数、総資産価額、取引金額などにより、大会社、中会社、小会社の区分を確認します。

特定会社該当性

株式等保有特定会社、土地保有特定会社、比準要素数1の会社、開業後3年未満の会社などを確認します。

直前期末後の重要事実

相続開始時点までに生じた資産構成、収益、株式数、取引条件の変化を評価資料と整合させます。

順序が重要総則6項リスクを検討する前に、まず通達の通常ルールでどの評価区分に入るかを正確に判定します。特定会社該当性は、総則6項とは別の通常ルールです。
Section 04

M&A価格と相続税評価額の乖離と総則6項リスク

価格差だけでなく、契約の拘束力、租税負担軽減目的、証拠資料を確認します

M&A価格と相続税評価額が乖離する理由

M&A価格と相続税評価額は、同じ株式を対象にしていても評価目的、評価対象、価格形成要因が違います。次の一覧は、価格差が生じる主な理由を整理したもので、単純な倍率差だけで相続税評価を置き換えられない理由を読み取れます。

Purpose

評価目的が違う

相続税評価は課税上の公平と画一性を重視し、M&A価格は交渉、将来収益、シナジー、契約リスクを反映します。

Target

評価対象が違う

相続税評価では個別株式を評価し、M&Aでは全株式、支配権、経営権、顧客基盤、人材、許認可などを一体で見ることがあります。

Buyer

買主固有の価値がある

同業買主の店舗網統合、仕入条件改善、重複コスト削減、地域シェア拡大などの価値が価格に含まれることがあります。

Risk

価格調整や補償が残る

運転資本調整、純有利子負債調整、表明保証違反、補償、アーンアウト、エスクローなどで最終価値が変動することがあります。

最高裁令和4年4月19日判決の基本枠組み

最高裁は、相続税法22条の時価を客観的交換価値と解し、通達評価額を上回る価額で課税しても、その価額が客観的交換価値を上回らない限り直ちに相続税法22条に違反するものではないとしました。一方で、課税庁が特定の納税者だけに通達評価額を上回る価額を用いることは、合理的理由がなければ平等原則に違反し得るとも整理しています。

この判決で重視されたのは、単なる通達評価額と鑑定評価額の乖離だけではありません。相続税負担が著しく軽減されること、近い将来の相続における税負担軽減を知り期待して購入と借入れを企画実行したこと、他の納税者との間に看過し難い不均衡が生じることが考慮されました。

東京高裁令和6年8月28日判決の事案整理

次の比較表は、M&A基本合意後の相続に関する東京高裁事案の主要事実を整理したものです。価格差の大きさだけでなく、基本合意の拘束力、相続後の交渉、裁判所の判断を並べて見ることで、総則6項適用の限界を読み取れます。

項目内容
被相続人非上場会社の大株主、代表取締役
M&Aの進行秘密保持契約、M&Aアドバイス契約、基本合意、買収監査
基本合意1株105,068円で売却する予定。ただし法的拘束力なし
相続開始基本合意後、最終契約前
相続後相続人らが交渉を継続し、同額で全株式を売却
相続税申告類似業種比準方式により1株8,186円
課税庁の処分総則6項により1株80,373円で更正
裁判所の判断総則6項の適用を認めず、納税者側勝訴

次の一覧は、総則6項リスクが高まりやすい事情を整理したものです。複数の事情が重なるほど、通達評価の一般的合理性だけでは説明が足りない可能性があるため、各項目に対応する証拠を確認してください。

売却の高度な確実性

相続開始前に売却価格、買主、対象株式数、主要条件が実質的に確定している場合です。

契約の法的拘束力

最終契約に近い文書が締結され、価格や譲渡義務に拘束力がある場合です。

形式的な条件だけが残る

クロージング条件が形式的で、相続開始時点で売却実行が高度に確実と見られる場合です。

評価引下げ目的の取引

株式移動、資産構成変更、会社規模変更、特定会社外し、比準要素調整などが税負担軽減目的で行われたと見られる場合です。

税務目的を示す資料

租税負担軽減を目的とする提案資料、金融機関資料、税務メモ、社内メールが存在する場合です。

看過し難い不均衡

通達評価では相続税が極端に低くなる一方、実際には高額代金を確実に取得できるような場合です。

証拠目的
基本合意書、意向表明書、秘密保持契約価格や譲渡義務の拘束力を確認する
FA契約、仲介契約M&A開始の経緯と事業上の目的を示す
買収監査資料相続開始時点で未確定だったリスクを示す
買主とのメール、議事録交渉が未了だった事実、価格変更可能性を示す
株主名簿、株式数推移株式集約の有無、相続後の行為を確認する
取締役会議事録、株主総会議事録譲渡承認や会社法手続の時点を確認する
価格算定資料M&A価格と通達評価額が異なる理由を説明する
相続税評価明細書通達評価の適正性を示す
医療記録、相続発生の予見可能性資料相続を前提とした租税回避目的の有無を判断する
税理士、弁護士、公認会計士の意見書評価判断の合理性を補強する
Section 05

M&Aと相続で問題になる会社法手続と株主名簿

譲渡制限株式、共同相続、名義書換、売主の確定を整理します

譲渡制限株式と会社法手続

非上場会社の株式には、譲渡制限が付されていることが多くあります。第三者に譲渡するには会社の承認が必要になり、承認しない場合の買取人指定や価格決定手続がM&Aのクロージングに直結します。相続による株式取得は売買とは異なる一般承継ですが、定款に定めがある場合、会社は相続その他の一般承継で譲渡制限株式を取得した者に売渡請求をすることがあります。

次の一覧は、M&A交渉中にオーナーが死亡した場合の会社法上の確認事項を整理したものです。税務評価だけではクロージングできないため、相続人が株主として権利行使できる状態か、会社側の承認手続がどこまで済んでいるかを読み取ってください。

譲渡制限株式

定款、譲渡承認機関、承認しない場合の買取人指定、価格決定手続を確認します。

会社法

譲渡承認

取締役会または株主総会の承認時点、議事録、承認条件を確認します。

クロージング

株主名簿

相続人への名義書換、株式数、議決権割合、対抗要件に関する資料を整えます。

証拠資料

共同相続

遺産分割前の共有状態、誰が売主になるか、相続人代表や換価分割の方針を整理します。

民事整理

共同相続と売主の確定

相続人が複数いる場合、遺産分割前の株式は共同相続人の共有関係に置かれます。M&Aの売主を誰にするか、株式譲渡契約に誰が署名するか、遺産分割協議を先に行うか、換価分割として売却するか、相続人代表を立てるかを整理する必要があります。

税務上も、誰が株式を相続し、誰が譲渡所得を申告するかに影響します。遺産分割が未了のまま売却する場合、譲渡所得の帰属、取得費加算の特例、相続税申告上の取得者、代金分配の整合性を確認します。

株主名簿と対抗要件

株式会社に対して株主であることを主張するには、株主名簿の記載または記録が重要です。相続後にM&Aを進める場合、相続人への株主名簿名義書換、遺産分割協議書、戸籍、相続関係説明図、印鑑証明書、譲渡承認議事録などが必要になることが多いです。相続税評価の観点でも、相続開始時点で誰がどの株式を保有していたかを示す株主名簿は重要な証拠になります。

Section 06

M&A後の譲渡所得と相続税申告期限を分けて考える

相続税評価額、所得税の取得費、取得費加算、準確定申告、10か月期限を整理します

相続税と譲渡所得税は別の税目です

M&Aで株式を売却すると、相続税とは別に譲渡所得税が問題になります。相続税は相続開始時点の財産価額に対する税であり、譲渡所得税は株式を売却したことによる所得に対する税です。相続税評価額が低いからといって所得税の取得費が低くなるわけではなく、逆に相続税評価額が高いからといって所得税の取得費が高くなるわけでもありません。

次の比較表は、相続税と譲渡所得税、準確定申告、相続税申告期限の関係を整理したものです。税目ごとに見る時点と期限が違うため、M&A代金を納税資金に使う場合は、どの申告がいつ必要になるかを読み取ってください。

論点基本的な考え方注意点
相続税相続開始時点の財産価額に対する税株式か代金債権か、条件付き権利かを確認します。
譲渡所得税株式売却による所得に対する税取得費は原則として被相続人の取得費を引き継ぎます。
取得費加算の特例一定期間内に相続財産を譲渡した場合、相続税額の一部を取得費に加算できることがあります要件、添付書類、相続税額の確定時期、修正申告の可能性を確認します。
準確定申告被相続人に譲渡所得が帰属する場合に検討相続の開始があったことを知った日の翌日から4か月以内が期限です。
相続税申告被相続人が死亡したことを知った日の翌日から10か月以内遺産分割、株式評価、買主対応、納税資金の確保を並行して進めます。

4か月と10か月のスケジュール管理

M&A交渉中の相続では、相続開始から10か月の間に、相続人確定、株式評価、遺産分割、買主対応、契約締結、譲渡所得の試算、納税資金確保、税務署への説明資料作成を同時に進める必要があります。次の時系列は、期限の順番と並行作業を示しており、最初の1か月で体制を組めるかが大きな分岐点になることを読み取れます。

初月

相続人とM&A状況の把握

戸籍、株主名簿、契約書、買主との交渉状況、譲渡承認の有無を集め、専門職の役割分担を決めます。

4か月以内

準確定申告の要否を確認

被相続人に譲渡所得が帰属する可能性がある場合、契約日、引渡日、代金決済、株主名簿書換を確認します。

10か月以内

相続税申告と納税

非上場株式評価、総則6項分析、遺産分割、取得費加算の見込み、納税資金を整合させます。

売却後

譲渡所得申告

相続人が売却した場合は、相続税評価額ではなく被相続人から引き継いだ取得費を前提に計算します。

資金計画相続税評価額が1億円でM&A売却額が10億円でも、所得税の取得費が1億円になるわけではありません。被相続人の取得費が500万円なら譲渡所得は大きくなり得るため、取得費加算の特例を早めに検討します。
Section 07

M&A売却前後の死亡を具体例で比較する

基本合意後、最終契約後、クロージング後、相続後売却の違いを見ます

四つの具体例で見る評価の分岐

具体例を見ると、同じM&A売却前後の死亡でも、評価対象と税務処理が大きく変わることが分かります。次の比較表は、四つの典型場面を横並びにしたもので、死亡時点、価格の確定性、残る条件、税務上の注意点を読み取ってください。

前提評価と税務の方向性
例1 基本合意後に死亡基本合意価格1株100,000円、価格と譲渡義務は法的拘束力なし、買収監査未了、最終契約未了、通達評価額1株8,000円まず取引相場のない株式として通達評価を行います。相続後の同額売却は重要な資料ですが、そのまま相続税評価額になるとは限りません。
例2 最終契約後に死亡株式譲渡契約を締結、譲渡価格10億円で確定、形式的な書類提出のみ、譲渡承認取得済み、代金未収被相続人が実質的に売買代金債権を有していたと評価される可能性があります。単純に株式名簿書換前だから通達評価で足りるとは限りません。
例3 クロージング後に死亡株式譲渡完了、受領済み代金8億円、エスクロー2億円、表明保証違反がなければ2年後返還、クロージング後6か月で相続開始相続財産は株式ではなく、預金、エスクロー返還請求権、場合によっては補償債務です。返還可能性や条件付き債権の評価を検討します。
例4 相続後売却で所得税負担が大きい相続税評価額1億円、M&A売却額10億円、被相続人の取得費500万円、相続人が売却所得税の取得費は原則として被相続人の取得費を引き継ぎます。取得費加算の特例を検討しないと納税資金計画が崩れることがあります。

例1に近い場合の実務整理

基本合意後に死亡し、相続後に同額で売却した場合は、東京高裁令和6年8月28日判決の事案と近い構造になります。ただし、実務では基本合意書の文言、買主の拘束力、買収監査の状況、株式集約の難易度、相続発生の予見可能性、税務上の意図を証拠で整理する必要があります。

例2と例3に近い場合の実務整理

最終契約後で主要条件がほぼ満たされている場合は、契約上の権利義務、解除可能性、条件未充足の実質、対抗要件を精査し、税務意見書を作成することが考えられます。クロージング後に死亡した場合は、株式評価ではなく未収入金、エスクロー返還請求権、アーンアウト請求権、補償債務の評価に焦点が移ります。

Section 08

M&Aと相続税の税務調査で問われる事項と専門職の役割

調査で確認される時系列、契約、価格、資料、専門職の分担を整理します

税務調査で問われやすい事項

M&A直前または直後の相続では、税務調査で「売却はいつ、どの程度確実になっていたのか」「通達評価とM&A価格の差をどう説明するのか」が問われやすくなります。次の比較表は、調査で確認されやすい項目を目的別にまとめたもので、事前にどの資料を準備すべきかを読み取れます。

確認領域問われやすい事項
M&A開始経緯M&A交渉はいつ始まったか、誰が提案したか、買主候補は何社いたか。
契約と価格意向表明書、基本合意、最終契約の締結日、価格決定時期、基本合意価格の拘束力。
未確定要素買収監査で価格変更の可能性はあったか、相続開始時点で売却はどの程度確実だったか。
株式集約他株主からの買取りや株式集約は相続前に完了していたか。
税務目的相続税負担軽減を目的とする助言や資料はあったか。
通達評価会社規模、特定会社該当性、類似業種比準方式の比準要素、直前期末後の重要事実の扱い。
申告整合性相続後の売却価格を税理士へ伝えたか、譲渡所得申告との整合性はあるか。

専門職ごとの役割

M&Aと相続が重なる案件では、税務だけでなく民事、会社法、会計、評価、登記、事業承継の論点が同時に動きます。次の一覧は専門職ごとの主な役割を整理したもので、どの論点を誰に確認すべきかを読み取るために使えます。

弁護士

遺産分割、遺留分、相続人間の紛争、株式譲渡契約、表明保証、補償、会社法手続、税務訴訟の入口を担当します。

民事・契約

税理士

相続税申告、取引相場のない株式評価、譲渡所得申告、取得費加算の特例、準確定申告、税務調査対応を担当します。

税務申告

公認会計士・株式価値評価専門家

DCF法、類似会社比較法、取引事例法、純資産法、事業計画の合理性、EBITDA倍率、シナジー、価格調整条項を分析します。

価値分析

司法書士

相続関係書類、戸籍収集、遺産分割協議書、会社の役員変更、代表者変更、定款確認、議事録整備などを支援します。

書類・登記

不動産鑑定士

不動産保有会社の株式評価で、土地建物の時価、賃貸不動産の収益性、特殊不動産の評価を担当します。

不動産評価

中小企業診断士・M&Aアドバイザー

事業承継計画、後継者不在問題、事業価値の向上、買主探索、交渉過程の整理に関与します。

事業承継
説明姿勢M&A資料を隠すのではなく、相続開始時点で未確定だった事情、事業上の必要性、通達評価の計算根拠、総則6項が適用されない理由を体系的に説明できる形にします。
Section 09

M&A売却前死亡時の実務チェックリスト

初動資料、評価資料、説明資料、申告資料をまとめて確認します

初動チェック

初動では、相続税評価とM&Aクロージングの双方に必要な資料を同時に集める必要があります。次の比較表は、確認項目と資料を対応づけたもので、死亡日、株式数、契約状況、税務申告、納税資金を一つの時系列で整理するために使えます。

チェック項目確認資料
死亡日、相続開始日死亡診断書、戸籍
相続人戸籍、法定相続情報一覧図
株式数株主名簿、株券、出資証明、法人税申告書別表
M&A進行状況NDA、意向表明書、基本合意書、最終契約書
価格の拘束力契約書の拘束条項、解除条項、停止条件
買収監査質問リスト、報告書、未解決事項
譲渡制限定款、取締役会議事録、株主総会議事録
評価方法決算書、勘定科目内訳、評価明細書
税務申告相続税、準確定申告、譲渡所得申告
納税資金売却代金入金予定、借入、延納、物納可能性

申告書に添付または保存を検討する資料

申告時の説明資料は、多ければよいわけではなく、時系列、契約拘束力、未確定条件、通達評価、M&A価格差の理由、総則6項分析が分かる形に整理することが大切です。次の一覧は添付または保存を検討する資料を並べており、税務署に説明する論点の抜け漏れを読み取れます。

Tax Return

株式評価の資料

取引相場のない株式の評価明細書、評価会社の直近決算書、法人税申告書、株主名簿、議決権割合の説明を整えます。

Classification

判定の説明資料

同族株主等判定、会社規模判定、特定会社該当性の検討メモを準備します。

M&A Process

M&A進行状況

時系列表、基本合意や最終契約の法的拘束力に関する意見、相続後売却がある場合の譲渡所得試算を整理します。

Clause 6

価格差の説明

M&A価格と通達評価額が乖離する理由、総則6項が適用されないと考える理由、取得費加算の特例の検討資料を準備します。

実務の第一歩M&Aと相続が交錯する案件では、早期に専門職を集め、時系列と権利関係を一枚の表に落とし込むことが最も実務的な出発点です。
Section 10

M&Aと相続税評価が遺産分割・遺留分に与える影響

税務評価と民事上の分配価値を混同しないことが重要です

相続税評価と遺産分割の評価は一致しないことがあります

M&A売却前にオーナーが死亡すると、税務だけでなく、相続人間の利害対立が強くなることがあります。株式の通達評価額が低く、M&A売却価格が高い場合、遺産分割でどの価額を基礎にするかが争われることがあります。

次の比較表は、相続税評価、遺産分割、遺留分で評価の目的が違うことを整理したものです。同じ株式でも場面ごとに重視される価値が違うため、税務評価だけで民事上の分配価値を決められないことを読み取ってください。

場面評価の目的争点になりやすい点
相続税申告課税目的の評価相続開始時点の財産、通達評価、総則6項リスク
遺産分割相続人間の分配価値の調整協議時点の時価、売却可能価格、会社支配権、換価可能性、相続人の関与
遺留分最低限の取得分の調整特定の相続人が株式を取得し、その後高値で売却した場合の不公平感

制度変更時に確認すべき論点

取引相場のない株式の評価は、制度上も実務上も見直しの議論が続いています。国税庁は令和8年に、取引相場のない株式の評価に関する有識者会議を開催し、株主区分、会社規模、類似業種比準方式、純資産価額方式、特定の評価会社などの論点を整理しています。

次の一覧は、制度変更や新しい裁判例が出たときに確認すべき論点をまとめたものです。財産評価基本通達、相続税法、所得税法、会社法、国税庁タックスアンサー、裁判例の更新が、M&A売却前死亡の評価に影響し得ることを読み取ってください。

株主区分

同族株主等判定や少数株主評価の考え方に変更がないかを確認します。

会社規模

大会社、中会社、小会社の区分基準や比準要素の扱いを確認します。

評価方式

類似業種比準方式、純資産価額方式、配当還元方式、特定会社の評価方法を確認します。

総則6項

最高裁判決や高裁判決、裁決事例の蓄積により、特別な事情の判断枠組みが変化していないかを確認します。

Section 11

M&Aと相続税評価の専門家向け論点整理

相続税法22条、後発的証拠、M&A価格の客観性、説明責任を整理します

相続税法22条と評価通達の関係

相続税法22条の時価は客観的交換価値と解されます。評価通達は、その時価評価を実務上画一的に行うための行政基準です。評価通達に従うことは通常合理的ですが、評価通達が国民に直接の法的効力を持つわけではありません。裁判では、相続税法22条の時価、評価通達の一般的合理性、平等原則、総則6項の合理的理由が問題になります。

相続開始後の売却事実の位置づけ

相続開始後の売却事実は、相続開始時点の時価を推認する後発的証拠となり得ます。しかし、後発事実そのものを課税時期の事実に置き換えることはできません。特に、相続後の相続人の努力、代表者交代、株式集約、買主との再交渉、買収監査完了により売却が実現した場合、売却価格を相続開始時点の確定価値と同視することには慎重な検討が必要です。

次の一覧は、専門家が説明資料を作るときに分解すべき論点を整理したものです。M&A価格を客観的交換価値の証拠として扱う場合でも、買主固有の価値や契約条件を切り分ける必要があることを読み取れます。

Evidence

後発的証拠

相続後売却は時価推認資料になり得ますが、相続開始時点の事実と同一視できるかを検討します。

Objectivity

M&A価格の客観性

第三者間価格でも、買主固有のシナジー、支配権プレミアム、競争入札、補償リスク、アーンアウトを分解します。

Purpose

租税負担軽減目的

M&A開始の動機、後継者不在、経営課題、買主提案、金融機関資料、税務アドバイスの内容を確認します。

Disclosure

説明責任の設計

時系列、契約拘束力、未確定条件、通達評価、価格差の理由、総則6項分析を簡潔に整理します。

申告書にどこまで説明資料を付けるか

添付資料が少なすぎると、調査で重要事実を十分に説明していないと見られる可能性があります。一方、未整理のM&A資料を大量に添付すると誤解を招く可能性があります。望ましいのは、時系列、契約拘束力、未確定条件、通達評価、M&A価格差の理由、総則6項分析を簡潔に整理した意見書を添付または保存することです。

Section 12

M&Aと相続税のよくある質問

個別事情で結論が変わるため、一般的な考え方として整理します

Q1. 売却前に亡くなったら、相続税評価額は必ずM&A価格になりますか。

一般的には、必ずM&A価格になるわけではありません。相続開始時点で株式を保有していた場合は、まず取引相場のない株式として財産評価基本通達による評価を検討します。ただし、契約の拘束力、条件成就、相続後の交渉、総則6項リスクによって結論が変わる可能性があります。具体的な対応は、契約書や評価資料を整理したうえで弁護士、税理士等の専門家へ相談する必要があります。

Q2. 相続後に高値で売れた場合、相続税申告を修正しなければなりませんか。

一般的には、後日の高値売却だけで直ちに修正申告が必要になるとは限りません。ただし、相続開始時点で売却が高度に確実だった、契約上の代金債権と同視できた、通達評価が著しく不適当だった、申告時に重要事実を把握していたのに説明が不足していた場合には、修正申告や更正リスクが生じる可能性があります。具体的には専門家による個別検討が必要です。

Q3. 基本合意書に価格が書かれていたら、その価格で評価しますか。

一般的には、基本合意の拘束力によって扱いが変わります。価格や譲渡義務が法的拘束力を持たない場合、基本合意価格を相続財産である売買代金債権と同視するのは困難なことがあります。ただし、文言、交渉経過、条件の充足状況で結論が変わるため、契約書と関連資料を確認する必要があります。

Q4. M&A価格と通達評価額の差が10倍以上あると危険ですか。

一般的には、差が大きいことは調査リスクを高める事情になります。しかし、価格差だけで特別な事情があるとは限りません。税負担軽減目的、取引の組成、他の納税者との不均衡、契約の確定性などで判断が変わる可能性があります。具体的な見通しは、評価明細書とM&A資料を整理して専門家に確認する必要があります。

Q5. 相続税評価額を下げるためにM&A前に株式や資産を動かしてよいですか。

一般的には、租税負担軽減を主目的とする不自然な資産移動、株式移動、会社規模調整、特定会社外しは、総則6項や否認リスクを高める可能性があります。事業上の合理性、第三者性、手続の適正性、意思決定資料の整合性によって評価が変わります。具体的な実行可否は、事前に専門家へ相談する必要があります。

Q6. 相続税評価と遺産分割の評価は同じですか。

一般的には、同じとは限りません。相続税評価は課税目的の評価であり、遺産分割では実際の売却可能価格や協議時点の価値が重視されることがあります。相続人間の合意状況、売却の確実性、株式の支配権、換価可能性により結論が変わるため、税務と民事の両面から整理する必要があります。

Q7. 相続後に売却した場合、所得税の取得費は相続税評価額になりますか。

一般的には、相続税評価額がそのまま所得税の取得費になるわけではありません。相続により取得した株式等の取得費は、原則として被相続人の取得費を引き継ぎます。ただし、一定の要件を満たす場合には、相続税額の一部を取得費に加算できる特例を検討できる可能性があります。具体的な適用関係は税理士等へ確認する必要があります。

Q8. 税務署にM&A資料を出すべきですか。

一般的には、申告時点でM&Aが成立または具体化している場合、資料の出し方は慎重に検討する必要があります。資料を隠すのではなく、相続開始時点の未確定性、通達評価の適正性、M&A価格との違いを説明できる状態にしておくことが重要です。具体的な提出範囲や説明方針は、弁護士、税理士等と統一して検討する必要があります。

Section 13

M&A売却前に亡くなった場合の株式評価のまとめ

権利関係、通達評価、価格差の説明を一体で整えることが重要です

M&Aと相続税の関係で最も重要なのは、M&A価格と相続税評価額を同じものと考えないことです。売却前に亡くなった場合、相続開始時点で被相続人が保有していた財産が株式なのか、代金債権なのか、条件付き権利なのかを確定し、そのうえで取引相場のない株式の評価、総則6項リスク、会社法手続、譲渡所得、遺産分割を横断的に検討します。

相続開始前にM&Aの基本合意があり、相続後に高値で売却されたとしても、それだけで売却価額が相続税評価額になるわけではありません。東京高裁令和6年8月28日判決は、価格差のみで総則6項を適用することの限界を示しました。一方で、最高裁令和4年4月19日判決は、租税負担の公平に反する特別な事情があれば、通達評価を超える評価が適法となり得ることを示しています。

次の一覧は、M&A売却前に死亡した場合の株式評価で最後に確認すべき三つの実務ポイントです。各項目は税務調査、譲渡所得申告、相続人間紛争、クロージングに連動するため、どの資料で説明できるかまで確認してください。

Point 1

権利関係を確定する

相続開始時点の権利関係を契約書、譲渡承認、株主名簿、代金決済状況で確定します。

Point 2

通達評価を正確に行う

財産評価基本通達による株式評価を、同族株主等判定、会社規模、特定会社該当性から正確に行います。

Point 3

価格差を説明する

M&A価格との乖離について、総則6項を見据えた証拠と説明資料を準備します。

Reference

この記事の参考情報源

公的資料、裁判例、一般化した実務解説名のみを掲載しています

法令・通達

  • e-Gov法令検索「相続税法」
  • e-Gov法令検索「民法」
  • e-Gov法令検索「会社法」
  • 国税庁「財産評価基本通達 第1章 総則」

国税庁資料

  • 国税庁タックスアンサー「No.4638 取引相場のない株式の評価」
  • 国税庁質疑応答事例「相続開始時点で売買契約中であった不動産に係る相続税の課税」
  • 国税庁タックスアンサー「No.1463 株式等を譲渡したときの課税」
  • 国税庁タックスアンサー「No.1464 譲渡した株式等の取得費」
  • 国税庁タックスアンサー「No.3267 相続財産を譲渡した場合の取得費の特例」
  • 国税庁タックスアンサー「No.2022 納税者が死亡したときの確定申告」
  • 国税庁タックスアンサー「No.4205 相続税の申告と納税」
  • 国税庁「取引相場のない株式の評価に関する有識者会議資料」

裁判例・実務解説

  • 最高裁判所第三小法廷令和4年4月19日判決、令和2年(行ヒ)第283号、相続税更正処分等取消請求事件
  • 法律実務解説(M&A基本合意後の非上場株式評価に関する解説)
  • 税務実務解説(非上場株式の相続評価に係る総則6項の裁判事例)
  • 税務実務解説(M&A直前の相続で取得した株式評価に関する解説)